随着经济体制的改革的不断推进，现代企业制度的建立，企业的经营方式，管理模式和运行机制都发生了深刻的变革。特别是正式加入WTO后，由于关税减让、非关税壁垒逐步取消，市场准入逐步放开，国际大公司的低成本高质量的产品，将越来越多地涌入中国市场，迫切要求我们提高自身的竞争力，与国外大公司论伯仲。因此建立以财务管理为中心的运行机制是适应现代企业制度要求，符合社会主义市场经济的客观规律。通过机制的作用使企业的物流和资金流正常运转是现代财务管理的核心内容，搞好财务管理，能协调各生产要素之间的组合，从而保证企业正常运转。
一、财务运行机制
（一）、财务运行机制的概念
财务运行机制是指财务各要素之间彼此依存，有机结合和自动调节所形成的内在关联和运行方式，它是企业财务机制的主要部分。
从理论上讲，财务运行机制是财务活动规律和资金运行规律内在表现，是财务管理体制存在并发挥作用的依据，并成为宏观政策和微观效益的结合线。
从实践上看随着现代企业制度建立，赋予企业独立财权，企业成为自主经营自负盈亏的实体。企业如何改革和完善企业的组织方式、经营方式、筹资方式、投资方式、分配政策，以市场为导向吸取最优的财务管理思想、观念和理论，建立最优的财务结构和投资结构，及时掌握相关的财务信息，制定科学的财务战略和决策、财务计划，组织企业的财务活动，确保资金运动的正常循环和周转，处理企业与各方的财务关系具有重要意义。
（二）、财务运行机制的内容
1，自主经营机制
建立现代企业制度，归于企业作为法人实体所拥有的法人财产权，享有独立的财务管理权，承担相应财务责任和风险。企业财务管理主要包括筹资管理，投资管理，营运资金管理，收入分配管理，所谓自主经营就是保证企业根据成本效益原则、风险收益均衡原则自主按排自动运行。
首先：企业所需资金必须由企业根据市场资金的供求关系自主选择筹资渠道和筹资方式，确定合理的资金结构，以最小的筹资成本获得最多的资金。
其次：在投资活动中企业根据风险收益均衡原则，成本效益原则，在法律允许的范围内确定投资方向、投资时机、投资规模、投资结构，而不受政府行政干预。
再次：在营运资金管理中企业自主采购生产所需要的原材料，自行确定生产产品的数量，自主决定产品的销售方式、销售渠道、销售市场和销售价格，打破传统的指令性计划的局面。