2003年4月20日，新任卫生部常务副部长高强在国务院新闻办公室举行的新闻发布会上坦承，卫生部的工作 “确实存在一些缺陷和薄弱环节”，此时，北京已确诊的 “非典”患者达到339例，疑似病例402例。
2003年5月12日，国务院颁布《突发公共卫生事件应急条例》。
截至到5月19日，全国内地共有SARS病人5236例，共有26个省（自治区、直辖市）发现SARS病例。
从疾病突发到万众一心抗击“非典”，中国政府和人民正从多个领域、多个层次进行着富有成效的努力和工作，可以称得上是举全国之力抗击“非典”。
国家的最高管理机构充分认识到了这次危机的严重程度。4月14日在有国务院总理温家宝出席的国务院常务会议上，确定了建设和完善国家突发公共卫生事件应急反应的原则：中央统一指挥，地方分级负责；依法规范管理，保证快速反应；完善监测体系，提高预警能力；改善基础条件，保障持续运行。在此基础上，全国防治非典型肺炎指挥部于4月24日成立，国务院副总理吴仪出任总指挥。与过去不同的是，政策和机制方面的修补与问题解决的过程同步进行，《突发公共卫生事件应急条例》迅速出台。
在国务院的统一指导下，中央各部委、地方政府相互协调，共同配合，组成了保障社会安全运行、全力抗击“非典”的联合战线，负责解决“非典”时期医药用品的生产组织、财力保障、物资供应、运输协调、市场监测、指挥调度、调剂余缺、资讯汇总和其它有关问题。
由于此次“非典”危机（或称为SARS危机）被定义为公共卫生部门的突发事件，国家卫生部成为受关注的焦点。在认识到体制上存在的不足之后，卫生部会同地方各级卫生部门紧急出台各种措施，建立和完善公共卫生预防和监测机制、疫情的信息系统和突发性事件的快速反应机制等等。
到目前为止，SARS疫情尚未完全得到控制和解决，但在全党和全国人民的共同努力下，我们看到了体制的优越性和团结的力量，因此，有理由相信危机是一定可以战胜的。
但从另一个侧面来看，总结和反思此次疫情中暴露出来的问题也是必要的。尽管有一些问题的结论现在还无法给出，但无论是此次SARS疫情，还是过去发生的其它危机，在政府应对方面都有一些共同之处，可以从中思考问题的根源所在。