袁世凯的北京政府希冀以开复达赖名号同西藏政教上层直接对话，消除隔阂，为此做了不懈努 力。在将恢复达赖名号命令电告噶厦的同时，派遣蒙藏事务局佥事马吉符等为册封使，取道印度赴藏册封，因英国阻挠未能入藏。12月又派温宗尧、王人文为西藏宣抚使，同样因英印政府阻挠过境未能成行。民国中央政府并未因此动摇中国坚持对藏主权的努力，西藏地方与中央政府间的关系也并未因此而中断。1912年8月，为组建中华民国第一届正式国会，北京政府颁布《中华民国国会组织法》和参众两院议员选举法，规定了西藏地方参加选举的办法和西藏当选议员可直接参与民国国政。次年4月，袁世凯加封九世班禅“致忠阐化”名号，赞扬他“效忠民国，维持藏事”之功。与此同时，为挫败帝国主义及分裂主义的图谋，北京政府颁行《西藏第一届国会选举法》，规定“西藏第一届参议员及众议员之选举，得于政府所在地行之”，“西藏之选举监督，以蒙藏事务局总裁充之。”随后，两院西藏议员正式选出，其中参议员及候补议员前后藏各五人，众议员及候补议员前后藏各五人，共40人。他们随即于次年参加了第一届国会常会，参与了中央对全国的治理工作。
袁世凯为使中央政府能与西藏地方直接谈判，于1913年 4月2日任命对藏事有经验的陆兴祺为护理驻藏办事长官。6月14日又任命陈贻范为西藏宣抚使、胡汉民为副使入藏疏通。后因陈贻范参加西姆拉会议，改令王鉴清为执行正宣抚事副宣抚使由川入藏。王鉴清抵昌都后，多次与达赖、噶厦致函联络，建议在昌都直接谈判。尽管帝国主义假手亲英分裂势力阻挠谈判进行，但中央与西藏的关系并未中断。尔后中国中央政府组织的政治会议、约法会议、国会等全国性政治会议，都有西藏地方的代表及议员参加。西藏当选的40名参众议员，不管属于达赖或班禅系统，都“夙明大义，首赞共和”，支持中央政府。这哪里有一点“独立”的影子！1914年，刚返回拉萨不久的达赖曾召集过一次西藏各宗及地方头人的代表会议，会议在议及西藏地方与中央的关系时，绝大多数代表提出：只需反对清朝末期对西藏的错误政策，并没有使西藏脱离祖国的意图。英人贝尔在《西藏之过去与现在》一书中也不得不承认：“西藏之官吏僧俗人民中，有左袒中国党，自无容讳……在农民中，吾等亦时时闻其盼望中国复来。……西藏虽倾向自主，尚不欲其在政治上联合已久之中国完全分离。”