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电子商务在功能上要求实现实时帐户信息查询。这就使电子商务系统必须在物理上与生产系统要有连接，这对于电子商务系统的安全性提出了更高的要求，必须保证外部网络（INTERNET）用户不能对生产系统构成威胁。为此，需要全方位地制定系统的安全策略。 就整个系统而言，安全性可以分为四个层次，如图1所示
1．网络节点的安全
2．通讯的安全性
3．应用程序的安全性
4．用户的认证管理
图1：安全性四个层次结构
其中2、3、4层是通过操作系统和Web服务器软件实现，网络节点的安全性依靠防火墙保证，我们应该首先保证网络节点的安全性。
一、网络节点的安全
1．防火墙
防火墙是在连接Internet和Intranet保证安全最为有效的方法，防火墙能够有效地监视网络的通信信息，并记忆通信状态，从而作出允许/拒绝等正确的判断。通过灵活有效地运用这些功能，制定正确的安全策略，将能提供一个安全、高效的Intranet系统。
2．防火墙安全策略
应给予特别注意的是，防火墙不仅仅是路由器、堡垒主机或任何提供网络安全的设备的组合，它是安全策略的一个部分。安全策略建立了全方位的防御体系来保护机构的信息资源，这种安全策略应包括：规定的网络访问、服务访问、本地和远地的用户认证、拨入和拨出、磁盘和数据加密、病毒防护措施，以及管理制度等。所有有可能受到网络攻击的地方都必须以同样安全级别加以保护。仅设立防火墙系统，而没有全面的安全策略，那么防火墙就形同虚设。
3．安全操作系统
防火墙是基于操作系统的。如果信息通过操作系统的后门绕过防火墙进入内部网，则防火墙失效。所以，要保证防火墙发挥作用，必须保证操作系统的安全。只有在安全操作系统的基础上，才能充分发挥防火墙的功能。在条件许可的情况下，应考虑将防火墙单独安装在硬件设备上。
二、通讯的安全
1．数据通讯
通讯的安全主要依靠对通信数据的加密来保证。在通讯链路上的数据安全，一定程度上取决于加密的算法和加密的强度。 电子商务系统的数据通信主要存在于：
（1）客户浏览器端与电子商务WEB服务器端的通讯；
（2）电子商务WEB服务器与电子商务数据库服务器的通讯；